未脱獄のiPhone&iPod TouchにてPDFを見れるビューアを試したのでご紹介します。
無料版のFiles liteは200MBまでのファイルを持ち歩くことができ、PDFの他にもワード、エクセル、パワーポイントのデータを開けます。データの転送はWebDAVを使って無線LANで直接iPhone(or iPod touch)とやりとりするので、無線LANが必要。その代わりワイヤレスでスマートなファイルストレージとして扱う事ができます。
ただしWebDAVなのでファイル操作がWeb方式なのと、セキュリティがかけられないので誰でも中のデータを読み消しできちゃう点がネック。使う際はこまめに無線LANを切るか、左下の丸を赤になるようにタップしてWebDAVサービスを止めましょう。有料版はパスワードセキュリティにも対応しているそうです。